Fragman analizi, genom üzerinde analiz edilmesi istenen bölgelere özgü olarak 1200 baz çiftine kadar yapılabilmektedir. Fragmanlar 6-FAM, VIC, NED, PED, LIZ floresan boyalarla boyanır ve Genetik Analizörde yürütülür. Bu kapsamda aşağıdaki çalışmalar yapılmaktadır.

• Microsatellite (STR) analizi
• SNP Genotipleme
• Fingerprinting
• Relative Fluorescence